Application PADOC (FR)

PADOC, l’application du cétologue

Introduction à PADOC

PADOC, c’est la Plateforme d’Acquisition de Données d’Observations Cétologiques.
PADOC vise primitivement à permettre l’étude comportementale détaillée de cétacés en milieu naturel. Elle est conçue par des cétologues pour être utilisable par des naturalistes passionnés ou des professionnels de l’environnement, et est, de nos jours, particulièrement utile pour aider à objectiver les dérangements des cétacés par les activités humaines.

PADOC est une application Android. Lorsqu’on étudie le comportement des cétacés en mer, PADOC permet de consigner différents types de données, comme la structure du groupe, les mouvements et positions des cétacés, les comportements de surface (comme les sauts, les souffles, les sondes, …), et bien sûr les réactions au bateau d’observation. L’heure et la position GPS sont automatiquement consignées à chaque entrée de données. Un fichier CSV est généré de manière à ce que les données soient facilement traitées une fois l’observation terminée.
Entre deux observations, un mode « Prospection » vous servira de livre de bord afin de pouvoir garder une trace de vos recherches même en l’absence de cétacés.

PADOC est développée par le Groupe de Recherche sur les Cétacés, mais le GREC n’a aucun accès aux données produites ou enregistrées par les utilisateurs de l’application.

Diffusée publiquement depuis 2018, PADOC est disponible gratuitement sur Play Store.

Spécifications du système

PADOC fonctionne sur pratiquement tous les terminaux Android (tablettes ou téléphones ; nous préférons cependant utiliser une tablette pour un meilleur confort de travail et un affichage plus harmonieux).
Aucun réseau téléphonique, forfait ou connexion de données mobiles n’est nécessaire.

Caractéristiques minimales :

• Écran de 4,7 pouces
• Version Android : Jelly Bean (Version 4.1.1, API 16)

Caractéristiques recommandées :

• Écran de 8 pouces
• GPS
• Compas

Mode d’emploi

Lancez l’application en tapant sur l’icône PADOC :

Sur la page d’accueil les trois petits points en haut à droite de l’écran vous emmènent vers les options puis les paramètres.

Vous pourrez ainsi :

• changer le langage de l’application (5 langues actuellement)
• modifier le dossier de stockage de vos données (Android version 7 et supérieure)
• choisir les paramètres environnementaux que vous souhaitez tenir à jour en mode Prospection

• activer l’option de saisie de données d’écoute acoustique en mode Prospection
• retrouver vos précédentes observations
• vérifier la version

De retour sur la page d’accueil, vous pouvez démarrer une prospection, ou directement une observation comportementale (ne pas oublier d’allumer le GPS).

La possibilité de « démarrer une prospection » vous permet d’accéder à un livre de bord électronique très simple d’utilisation, qui vous permettra de garder une trace de vos recherches même entre deux observations de cétacés. En tapant sur l’icône Crayon, vous pouvez ainsi indiquer régulièrement l’état de plusieurs paramètres environnementaux (vous pouvez choisir ceux-ci depuis les options de l’écran d’accueil), qui seront inscrits et géolocalisés dans votre fichier de travail à chaque mise à jour, ainsi que bien sûr au moment où vous trouverez des cétacés.

Un code visuel tricolore vous aidera à conserver ces données environnementales à jour lors de votre prospection : une diode verte indique un paramètre fraichement renseigné (moins de 25 minutes), mais une diode rouge indique une donnée obsolète (dernièrement confirmée il y a plus d’une heure). Entretemps, une diode jaune indique que la donnée est considérée toujours utilisable mais que vous devriez penser à la contrôler afin de garder votre journal de prospection à jour.

Notez que dans l’écran de saisie des données environnementales, deux types de paramètres cohabitent (ils sont séparés par une barre horizontale) : des paramètres de type « continu » (le vent, la houle, la détectabilité, etc ; ils sont préjugés rester exacts entre deux saisies successives sauf correction de votre part) et des paramètres de type « ponctuel » (la profondeur, la distance parcourue, la présence de faune ou d’éléments flottants, etc ; ceux-ci sont préjugés n’être valables qu’à l’instant où vous validez votre saisie).

Seuls les paramètres de type « continu » seront affichés avec leur diode sur l’écran de prospection, et seuls ceux-ci seront inscrits automatiquement à chaque ligne d’évènement dans votre log de prospection : les paramètres ponctuels ne sont inscrits dans votre log que dans la ligne où vous les indiquez, puis ne seront plus affichés dans les lignes suivantes sauf si vous les indiquez à nouveau.

Si vous avez activé l’option de saisie de données acoustiques, vous pouvez régulièrement renseigner le résultat des écoutes que vous faites à l’hydrophone en tapant sur le bouton représentant une impulsion acoustique ; l’écran qui s’ouvre vous permettra de consigner la synthèse de ce que vous avez entendu.

Si vous ne sélectionnez pas d’espèce probable, les signaux disponibles à « cocher » seront des signaux génériques. Mais si vous sélectionnez une, ou deux, espèce probable (elles vous sont suggérées lorsque vous commencez à écrire leur nom vernaculaire mais vous pouvez également sélectionner un groupe d’espèces si vous n’êtes pas sûrs, « Petit delphinidé » par exemple), la liste des signaux cochables s’étoffe avec les signaux habituels du répertoire de l’espèce que vous avez choisie.

De retour sur l’écran de prospection, tapez maintenant le bouton “Démarrer une observation”. Dans la boîte “Nouvelle observation”, sélectionnez l’espèce (sélectionner d’abord la “Zone” pour trouver l’espèce plus facilement).

Tapez le bouton “Valider” pour démarrer l’observation.

Vous êtes maintenant dans l’écran “Évènements”, prêt à consigner toutes sortes d’évènements.

Dans le coin en haut à droite, l’icône GPS vous indique si le GPS est fonctionnel (icône verte) ou en train de chercher la position (orange). Si elle est verte, vous pouvez toucher l’icône pour connaître votre position GPS. Si l’icône est rouge, cela signifie que vous avez oublié d’activer le GPS sur votre machine.

La première ligne de boutons vous permet de définir à quels individus les événements se rapportent. Vous pouvez sélectionner tout le groupe ou seulement une partie.

Tous les boutons du milieu se rapportent aux types d’événement que vous pouvez consigner ; ils peuvent se rapporter soit aux animaux, soit aux activités humaines survenant autour des cétacés.
Les boutons avec une flèche en bas à droite vous permettent d’entrer des détails, quand vous les pressez longuement.

Sur le bas de l’écran, vous avez la liste des événements déjà consignés. Un appui long sur un des items vous permet de l’effacer.

Pour changer la taille de groupe estimée, ou la structure du groupe, balayez vers la droite (ou tapez sur “Structure” dans la barre de menu).

Tapez juste “Confirmer” pour enregistrer les changements.

Vous pouvez aussi donner plus de détails sur la composition du groupe. N’oubliez pas de “Valider” les changements pour les sauvegarder.

Lorsque le groupe est composé de cinq animaux ou moins, l’application vous permet de les considérer de manière individualisée :

Pour entrer des données sur la vitesse et la position des cétacés, balayez vers la gauche (ou tapez sur “Déplacement” dans la barre de menu).

Pour entrer le relèvement ou la direction, vous avez 3 possibilités :

• 1 Cliquer sur une des flèches du compas correspondant
• 2 Taper au centre du compas et entrer la valeur au clavier
• 3 Pointer le terminal dans la direction voulue et taper le bouton au dessus du compas

Vous pouvez aussi entrer la distance des cétacés et une fourchette de vitesse (taper le bouton correspondant à la vitesse estimée).

Et n’oubliez pas de valider les données entrées.

Lorsque l’observation est finie, tapez le bouton “retour” de votre terminal Android et validez.

PADOC est prêt pour l’observation suivante, ou pour continuer votre prospection.

Analyse des fichiers CSV

Tous les fichiers CSV sont stockés dans le répertoire “Android/data/org.cetaces.padoc/files” de votre appareil. Sur les versions récentes d’Android (à partir d’Android 7), vous pouvez modifier cela dans le menu Paramètres, et choisir vous-mêmes l’emplacement d’enregistrement de vos fichiers.

Ils peuvent être facilement ouverts et traités avec des tableurs comme LibreOffice ou Excel. Attention, vos fichiers seront effacés de votre appareil si vous désinstallez PADOC, et nous n’avons jamais aucun accès à vos données : n’oubliez donc pas de les sauvegarder régulièrement sur d’autres supports.

La première ligne d’un fichier contient le titre de chaque colonne.

Notez que dans les fichiers nommés « LOG_xxx…xxx » qui correspondent aux fichiers de prospection, les colonnes correspondant aux paramètres que vous avez désactivés sont signalées par un ‘N/A’ dans leur première ligne (les lignes suivantes sont laissées vides). Selon votre convenance, vous pouvez donc soit garder ces colonnes par exemple par souci de compatibilité entre vos logs, soit simplement les supprimer de votre fichier.

Les fichiers CSV se prêtant facilement à l’utilisation par des tableurs ou des logiciels plus spécialisés comme R ou QGis, vous pouvez mener leur exploitation scientifique comme il vous plaira, en fonction de vos thématiques de recherche prioritaires du moment.

Avant une première utilisation…

Ne pas oublier de ‘jouer’ avec PADOC quand vous êtes à terre, et de manipuler les fichiers CSV. Vous comprendrez mieux comment l’appli fonctionne et son utilisation sera plus fluide.

Merci d’avoir choisi PADOC !

Et si vous voulez nous donner un petit coup de main… : Comme vous l’avez peut-être remarqué, certaines espèces ne sont pas encore illustrées. Pour ces animaux, nous sommes à la recherche de photographies libres de droits, et nous recevrons avec grand plaisir votre contribution si vous acceptez de partager votre travail à travers PADOC. Merci d’avance !
Enfin, cela va sans dire, n’hésitez pas non plus à nous contacter pour toute question ou suggestion !

Laurent Delrocq et l’équipe de développement du Groupe de Recherche sur les Cétacés